Après l’installation du grand-orgue par la maison MERKLIN-SCHÜTZE de Paris, la paroisse passa commande à la même maison d’un orgue de chœur pour accompagner la liturgie.On ne connait pas la date exacte de mise en service de l’instrument mais on sait qu’il était en place en 1872. Il se trouve à l’arrière du maître-autel.L’élégant buffet est dû aux frères Alphonse et Théophile KLEM alors installés à Nancy, à qui la basilique doit également une grande partie de son mobilier. Alphonse KLEM épousa d’ailleurs en 1872 la fille ainée de Joseph MERKLIN.L’instrument de 10 jeux sur deux claviers et pédalier possède une excellente qualité sonore.En 1911, le facteur KUHN de Männedorf (Suisse) a effectué quelques modifications mineures : La Gambe 8’ du Récit a été reconstruite, la pédale a reçu un emprunt du Bourdon 16’ du grand-orgue, un accouplement du Récit au Grand-orgue a été rajouté (à la place du tirant de coupure basses/dessus de la Trompette 8’) et un Trémolo a été ajouté.Au milieu des années 1990, le bel orgue subit un sort pour le moins curieux : une personne sans domicile se réfugia dans la basilique et plus précisément dans le buffet de l’orgue de chœur. Son bref passage a eu pour conséquence d’endommager sérieusement une partie de la tuyauterie, rendant l’orgue muet pour de longues années…L’instrument a été restauré en 2009 par le facteur Jean-Baptiste GAUPILLAT de Noviant-aux-Prés (Meurthe-et-Moselle). Il a retrouvé sa disposition et son éclat d’origine.
Autres caractéristiques :10 jeux - 2 claviers manuels de 56 notes et pédalier 27 notesTransmission mécanique des claviers et des jeuxAccouplement : II/ITirasses : I/P - II/PAppel TrompetteTremblant